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（四）“五江一溪”流域中上游保护区
闽江、九龙江、汀江、晋江、赛江和木兰溪是我省主要水系，流域面积约9．8万平方公里，占全省陆域总面积的80．7％。“五江一溪”中上游地区呈扇状水系分布，峡谷与盆谷相间排列，峡谷坡降大，盆谷坡降小，盆谷四周溪涧汇集，易造成洪涝灾害。区域内生态环境恶化，尤其是低效林分面积已达200万亩，占40％，相当部分地域森林吸纳水份的能力下降水土流失逐年加剧，河床淤积不断上升。
本区域生态环境建设的重点：以现有森林资源为基础，统筹规划，合理布局，保护“五江一溪”流域天然林资源，改善江河源头及一重山脆弱的生态环境；以治理水土流失，保障国土安全为重点，加快护岸林带和水源涵养林建设，提高各流域森林覆盖率，维护生物多样性。
（五）沿海旱地与风沙治理区
我省旱地和风沙区主要集中在沿海地区。沿海旱地占全省旱地面积75．5％，多为砂质土壤，保水保肥功能差。这一地区的成土母质主要是花岗岩、玄武岩风化发育而成，林业用地以红壤。砖红壤性土壤为主，原生植被破坏殆尽。沿海地区也是台风多发区，平均每年7．9次，且常伴有狂风、暴雨、巨浪、沙尘，破坏力大，危害范围广。
本区域生态环境建设的主攻方向是：沿海水资源紧缺地区，在加强新水源工程和跨流域弓体工程建设的同时，要重视水资源的节约、保护和合理配置。继续加快山美、东张、东圳、峰头、北引等大型灌区的续建配套与节水改造工程建设，抓好万亩以上重点旱片治理。大力发展旱作农业立体种植，生态果茶园综合建设和生物多层次循环利用等，加强农田环境保护，防止工业“三废”污染，减少农业化学物质和农业废弃物的污染。沿海风沙区要针对沿海防护林带老化、基干林带断带多、沙荒风口造林难度大、树种结构单一等问题，继续推进沿海防护林带建设，抓好40个沙荒风口、108公里基干林带建设，选择条件好的林地，建设果竹草基地。
（六）水源保护区
据我省1999年对口条生产、生活主要水源水系102个断面常规监测结果表明，76．4％的监测断面达到或优于国家地面水三类水质标准，但各水系有机物污染普遍存在，石油类污染尤为突出。在福州、厦门等16个城市的39处饮用水源地中，有22处饮用水源地的各项监测指标达到国家二类水质标准，但有13处饮用水源地的总大肠杆菌群指标超标。造成饮用水源地污染的主要原因是：我省工业废水污染仍较严重，工业排污口多沿江河分布，大部分废水未达标排放；城市环境承载力低，大部分城市没有建成污水处理厂和垃圾无害化处理场，污水处理率和垃圾无害化处理率低；农药、化肥不合理使用，低处理率的养殖业排污。
本区域生态环境建设的主攻方向：加强水环境监测，明确水功能区域划分，加快城市污水处理厂和垃圾无害化处理设施建设，严格控制工农业生产和城乡生活的污染物直接排入水体，防治水环境污染；做好植树造林、水土保持。生态农业建设工作，提高水源周边环境质量。
（七）矿山开采区
我省已发现矿产120多种，有1．5万多种矿产地（点），以非金属矿为主，较大型的能源矿产集中分布于龙岩市和永安市，均为无烟煤；花岗岩矿区主要分布于沿海一线；高岭土矿区主要分布在龙岩；金属矿中储量较大的有铁矿、铅锌矿、铜矿、锰矿、钨矿和金矿等，主要分布在闽西、闽东和闽北等地。由于特定的生产方式和现有的工艺水平，矿产资源的开发利用对生态系统造成了景观型、环境质量型、生物型破坏，引发较为严重的生态问题。此外，地下开采常引起土地、农田塌陷，地下水位降低，水土流失加剧，从而改变原有的生态系统平衡。
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