建立和实行“在国务院领导下，由地方政府负责、分级管理、以县为主”的管理体制。省政府和州、市政府、地区行署要加强义务教育统筹规划，搞好组织协调，在安排对下级转移支付时要保证农村义务教育的需要。县（市、区）政府对本地农村义务教育负有主要责任。其职责是：负责制定本地教育事业的发展规划并组织实施；负责中小学的布局调整、建设和管理；负责教职工工资的统一发放；负责中小学校长、教师的管理；负责本地教育经费的筹措和管理；指导学校教育教学工作。乡（镇）人民政府仍然是农村办学和管理学校的基本单位，在实施农村义务教育中负有重要责任。要继续发挥行政村在实施义务教育中的作用。乡（镇）、村要负责维护学校的治安和安全，划拨新建校舍所必需的土地，根据国家规定筹措教育经费，征收农村教育费附加，改善办学条件，依法保证适龄儿童入学。实行税费改革的地方，村上要通过“一事一议”的方式为学校解决办学中的具体问题。
实行教师工资统一发放制度。从2002年起，在试点的基础上，结合农村税费改革，逐步做到农村中小学教职工工资由县（市、区）统一管理和发放。原乡（镇）财政收入中用于中小学教职工工资发放的部分要相应划拨上交到县（市、区）财政，并按规定设立“工资资金专户”，由财政部门通过银行直接拨入教师在银行开设的个人帐户。
改革中小学校长选拔任用制度和教师管理制度。高级中学和完全中学校长由县级以上教育行政部门提名、考察或参与考察，按干部管理权限任用和聘任；其他中小学校长由县级教育行政部门选拔任用并归口管理。中小学教师的管理权上收到县，农村学校教师的补充和乡（镇）之间教职工的调剂、调动由县级教育行政部门负责。县级以上教育行政部门依法履行中小学教师的资格认定、招聘录用、职务评聘、培养培训和考核等管理职能。
建立健全基础教育投入保障机制。各级政府要把农村学校建设及危房改造列入基础设施建设统一规划，统筹安排。实行税费改革的地方，要建立危房改造专项经费。农村中小学公用经费，要根据省政府有关部门核定的标准和定额，除从学校按规定收取的杂费中开支外，不足部分由县乡两级政府通过财政预算予以安排。县级以上财政拨给乡镇的教育事业费和专项资金，由县级教育行政部门会同财政、计划等部门提出意见，报县级政府批准，下达到学校使用。
四、调整中小学布局，规范义务教育学制
按照“小学就近入学，初中相对集中，优化资源配置”的原则，调整中小学校布局。各地要因地制宜，从实际出发确定学校服务半径。农村小学和教学点原则上服务半径不足2.5公里的要予以调整合并；除交通十分不便的地方仍需保留必要的低年级教学点外，其他地方的教学点要予以撤并。在此基础上，鼓励有条件的地方以乡镇为单位或几个行政村联片举办寄宿制小学。初中布局的调整，要充分考虑农村初中适龄人口高峰的到来，原则上一个乡镇办一所初中，鼓励人口较少、距离较近的乡镇联片举办规模较大的独立初中。
