执行委员会主任由自治区主管水利工作的副主席兼任，副主任由自治区人民政府秘书长和计划、财政、水利行政主管部门负责人兼任，水利行政主管部门负责人为常务副主任。
执行委员会下设办公室，处理日常工作。办公室设在自治区水行政主管部门。办公室主任由执行委员会常务副主任兼任。
第十三条 塔管局是委员会的行政、技术职能机构，对常委会负责，同时受自治区人民政府水行政主管部门的行政领导。塔管局局长的任免须征得常委会同意。
第十四条 塔管局依据本条例的规定和常委会的决议、决定，具体实施常委会的决策；开展技术服务工作，负责塔里木流域水资源开发、利用、保护和管理的具体工作，行使河道管理、水工程管理、用水管理、水土保持管理等水行政管理职权，向常委会呈交年度工作报告和规划、计划、项目、预算等方面的报告，以及需由常委会协调、解决的其他事项的报告。
塔管局根据履行其职能的需要，设置若干办事机构。塔管局可以在干流和子流域设立地方办事机构，促进委员会各项职责的实施。地方办事机构应当与各地州和有关方面加强联系，建立密切协作、相互配合的和睦关系。
第十五条 塔管局应当在本条例实施后六个月内，向常委会提交关于各源流多年平均地表水径流量的报告，并提出维持塔里木河生态环境及相关环境所必需的年需水量的建议。
第十六条 常委会应当在与各地州和有关方面充分协商的基础上，提出用水分配方案的建议。各地州和有关方面应当依据常委会的建议，编报用水计划。
常委会应当及时研究各地州和有关方面编报的用水计划，并在本条例实施后一年内，就年度用水总量定额、不同情况和条件下的用水限额、权利与义务、违约责任等事项，以书面方式与各地州和有关方面签定用水协议。协议一经签定，即具法律效力。
在前款规定的期限内未能达成协议的，常委会应当就协议需确定的事项，上报自治区人民政府，由自治区人民政府在３个月内作出决定。自治区人民政府的决定，各地州和有关方面必须执行。
第十七条 年度用水总量定额经３年试行，并经评价、鉴定后确定为正式年度用水总量定额，未经常委会同意，不得变更。
