二、坚持正确的办会方向。农村合作基金会是由乡村集体经济组织和农户按照自愿互利、资金有偿使用原则而建立的社区性资金互助合作组织。必须坚持为农民服务、为农业服务、为发展农村经济服务的宗旨。管好用好集体资金，保障乡村集体经济组织的合法权益，挖掘农村资金潜力，支持社区内的集体经济组织、企业和农户发展生产，增加集体积累，促进农村经济的发展。农村合作基金会不是金融机构，不得办理存贷业务，不得以股金名义变相吸收存款，不得对城市居民和单位开展业务，不得以赢利为目的。资金只能在社区内有偿使用。
三、进一步加强对农村合作基金会的规范管理。建立农村合作基金会要坚持因地制宜，自愿互利的原则，以乡镇为主，有计划、有步骤地进行。目前已建立的地方，要重点抓好整顿完善和巩固提高，在当地政府的领导下，由农业行政部门牵头，会同中国人民银行等有关部门，对现有农村合作基金会进行一次检查，并由农业行政部门进行登记。尚未起步的地方，必须尊重群众意愿，不搞行政干预，同时，要先行试点，摸索经验，逐步推开，合作基金会的组织机构，要按照民主管理，加强监督、精简高效的原则设置，设会员代表大会、理事会、监事会，制定章程，明确职责。其业务的开展，必须严格按照农业部和
中国人民银行《关于加强农村合作基金会管理的通知》（农经发〔１９９４〕２１号）执行。
农村经济经营管理部门是农村合作基金会的主管单位，负责制定有关规章制度，加强农村合作基金会的具体指导。根据国家有关文件精神，乡镇合作基金会依托乡镇经管站设置，日常业务工作由乡镇经管站按合作基金会的章程办理，但帐务要严格分开，制度要健全。做到有章可循，保证合作基金会健康发展。
四、广泛聚集和合理投放资金。合作基金会在政策允许的范围内，要按照自愿互利、有偿使用的原则吸收股金。农村合作基金会的会员只能是乡（镇）、村社区农业集体经济组织和农户，会员须以资金入股，承认并遵守农村合作基金会的章程。其股金应以集体资金为主，股金要保持相对稳定。合作基金会会员股金所有权不变，并享有优先借款权。
合作基金会资金投放的对象主要是本会会员。投放的项目依本地经济发展的需要来确定。要坚持短期、小额和有效的原则；坚持“一事一借，有借有还，到期归还”的原则；坚持借款申请、审批、抵押、担保和“三查”（投放前调查、投放时审查、投放后检查）等制度。按投放项目分别不同档次合理收取资金占用费，资金占用费不准高于国家金融部门规定的利率标准，要综合运用行政、经济和法律等手段，保证借款如期收回，避免资金的沉淀与损失，尽可能发挥投资的效益。
