（三）５％留收费所在地，用于科研、监测仪器购置、环境保护宣传教育等业务性开支；
（四）５％交上一级环境保护部门，用于环境污染的综合性治理；
（五）３％交上一级环境保护部门，用于科研和新技术推广等业务性开支。市辖县（区、市）按本条第（三）项执行。
提高标准征收的排污费、加倍征收的排污费、罚款和滞纳金留收费所在地，由财政部门拨给同级环境保护部门，用于环境污染综合性治理。
十五、第十七条改为第十四条并修改为：排污费和罚款收入的缴拨方法按有关规定执行。
十六、增加一条为第十五条：对积极缴纳排污费，合理使用污染源治理专项基金，在治理污染中取得显著效益的单位和个人，由当地人民政府或环境保护部门给予表彰或奖励。
十七、第十一、十二条合为第十六条并修改为：排污单位有下列情形之一的，由环境保护部门根据情节轻重，给予批评教育或罚款，并提请有关部门对其单位领导人和有关责任人给予行政处分，直至追究刑事责任：
（一）采用渗坑、渗井排放超标准污染物的；
（二）伪造、隐瞒排放污染物数量和监测数据的；
（三）采取稀释方法降低排放浓度的；
（四）不按本办法规定缴纳排污费的；
（五）向饮用水源、水产养殖场、名胜古迹、风景游览区、疗养区等地直接排放超标准污染物的；
（六）运输有毒有害物质造成环境污染的；
（七）因管理不善或违章作业造成环境污染的；
（八）向水体倾倒垃圾、废渣、放射性物质等废弃物的；
（九）产生噪声、震动、恶臭，严重扰民的；
（十）新建工程项目，不执行“三同时”规定的。
罚款二千元以下的，由县级环境保护部门决定；罚款二千元以上至五万元以下的，由市、地环境保护部门决定或批准；罚款五万元以上的，由省级环境保护部门决定或批准。
十八、增加一条为第十七条：排污单位对缴费通知或者处罚决定不服的，应先按缴费通知或者罚款通知付款，同时可在收到缴费通知之日起二十日内或者在收到处罚通知之日起十五日内向人民法院起诉，期满不起诉又不执行的，环境保护部门可申请人民法院强制执行。
十九、第十八条修改为：市、地、县（市）环境保护部门应建立健全环境保护监理机构，配以必要的监理人员和专职财会人员，纳入编制，负责所辖区域内排污费的征收、管理和监督使用。
