第五条 凡使用本水系水源的单位，必须向所在地区的环境保护办公室提出申请，经水系保护领导小组办公室批准后方可使用。
第六条 在干流及主要支流上兴建大、中型水利工程，加发电站、水库、运河等。在建设前必须进行生态环境变化的研究并采取预防措施。经领导小组批准后方可兴建。大型水库的坝下最小保证流量必须由水力电力部规定，报国务院环境保护领导小组和松花江水系保护领导小组备案，严格执行。
第七条 保护松花江水系源头，保护森林资源。加强自然保护区的管理，保持水土，涵养水源。
第三章 防治水系污染
第八条 松花江水系水质要符合国家规定的地面水卫生标准、渔业水质标准和农田灌溉水质标准。
第九条 凡是向水流中排放污水的单位，必须向本地区环境保护办公室提出申请，并报松花江水系保护领导小组备案，经批准后方可排入。所排污水必须符合国家规定的排放标准。各股污水的具体排放标准，要根据当地具体情况（河流的水文、用途、工业布局、污水流量等）由松花江水系保护领导小组分别研究确定。
第十条 严禁采用渗井、渗坑或漫流方式排放有害废水。输送有害废水的管道和明渠，必须有防渗措施。水上船只污水必须经过处理，达到排放标准。
第十一条 严禁向水库、湖泊、河道中倾倒废渣、垃圾。所有工矿企事业在河道、湖泊、水库岸边堆放废渣，要按其种类、性质、数量及对人体健康、空气和水体损害程度进行统一规划。堆放废渣的场地必须有防护措施，防止流失，防止渗漏。
第十二条 流域内建设城镇、工矿企业，必须全面规划，合理布局。所排污水，要进行综合治理。
第十三条 流域内一切新建、改建、扩建的工程项目和科研单位，必须做到“三废”治理措施与主体工程同时设计、同时施工、同时投产，否则不准建设，不准投产。
第十四条 各单位工业用水必须厉行节约，循环使用，一水多用，压缩排污量。
