市水利行政部门是市人民政府的水行政主管部门，负责全市水资源的统一管理工作。城市建设行政主管部门归口管理城市节约用水、城市规划区地下水的开发利用和保护；环境保护部门对水污染防治进行监督管理。
旗、县水利行政部门是同级人民政府的水行政主管部门，负责本行政区域内水资源的管理工作。其他各有关行政主管部门按照同级人民政府确定的分工，负责有关水资源的管理工作。
郊区水利行政部门是同级人民政府的水行政主管部门，负责由市人民政府划定地区的水资源管理工作。
第七条 市水行政主管部门的主要职责：
（一）贯彻实施《
中华人民共和国水法》、《
内蒙古自治区实施〈中华人民共和国水法〉办法》以及有关水行政管理的法律和法规；
（二）统一管理全市水资源，负责向全市人民生活、生产提供水资源，归口管理水土保持和农村乡镇供水、节水；
（三）会同有关部门统一组织全市水资源的综合科学考察研究和调查评价，编制培育保护开发利用水资源和防治水害的综合规划，制定长期供水规划；
（四）确定跨旗、县、郊区的水量分配方案和水工程项目，经市人民政府授权协调处理水事纠纷；
（五）组织实施取水许可制度；
（六）负责督促、检查对水工程和水利设施的维护管理工作；
（七）依照法律、法规的规定应当履行的其他职责。
第三章 水资源开发利用
第八条 开发利用水资源必须进行综合科学考察和调查评价。
市水行政主管部门会同有关部门，编制市水资源综合规划和本行政区域内河流的流域规划，报市人民政府批准并报自治区水行政主管部门备案。
第九条 兴建水工程或者其他建设项目，影响原有工业、农业、居民生活用水及供水水源的，建设单位应当按照有关规定合理支付安置费和补偿费。
第十条 开发利用地下水，必须在水资源调查评价的基础上，实行统一规划，加强监督管理，坚持采补平衡的原则，防止水源枯竭、地面沉降和水质污染。
对于地下水位相对上升、埋深浅、盐碱、涝洼地区，鼓励开采潜水资源，在无排水设施前提下，限制引用地表水。
