对超出排污总量控制指标的排污单位，发放《排放污染物（临时）许可证》，并限期采取有效措施削减排污量，在限期内达到排放总量控制指标。
第七条 暂不实行水污染物排放许可证制度的单位，只进行排污申报登记，不发放《排放污染物许可证》。
第八条 禁止无证排放水污染物。实行水污染物排放许可证制度的单位，应按环境保护行政主管部门的要求获得《排放污染物许可证》或《排放污染物（临时）许可证》，在规定期限届满后无许可证排放污染物的，属违法排污。
第九条 《排放污染物许可证》和《排放污染物（临时）许可证》有效期分别定为两年和一年，在有效期满前两个月内，排污单位必须重新申请换证。
第十条 持有《排放污染物许可证》和《排放污染物（临时）许可证》的单位，不免除缴纳排污费和其它法律、法规规定的责任。
第十一条 持有《排放污染物许可证》的排污单位，不按要求排放污染物的，环境保护行政主管部门有权终止或吊销《排放污染物许可证》；持有《排放污染物（临时）许可证》的排污单位，逾期仍达不到限期治理要求的，也要中止或吊销《排放污染物（临时）许可证》。被中止《排放污染物许可证》的单位，在规定时间内达到《排放污染物许可证》要求的，环境保护行政主管部门准予恢复被中止的《排放污染物许可证》。被吊销《排放污染物许可证》的单位，必须重新申请《排放污染物许可证》。
第十二条 持有《排放污染物许可证》的单位，应按要求定期向环境环境保护行政主管部门如实填报有关排污情况报表；持有《排放污染物（临时）许可证》的单位，也应定期如实填报排污状况表，报告削减污染情况，经削减达到排放总量控制指标时，可以申请《排放污染物许可证》。
第十三条 新建、扩建和改建项目（包括技术改造项目），应在试生产（营业）后三个月内按《建设项目环境管理条例》的有关规定向环境保护行政主管部门申请办理建设项目“三同时”竣工验收，并同时申请办理《排放污染物许可证》，待建设项目通过“三同时”验收和领到环境保护行政主管部门审核发放的《排放污染物许可证》后，方能正式生产（营业）。
第十四条 排污单位因产品、产量变化等造成排放污染物有大变化或改变排放方式、排放去向及终止排放时，应提前一个月向环境保护行政主管部门申请办理变更换证手续，需增加排放量的，必须经审核批准方能调整排放量。
