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（三）资金管理
１、农业综合开发项目投资中的国家和地方各级预算内农业发展基金，资金下达要列入各级财政预算，按项目进行组织拨款，并按财政部门的规定编报年度预算和决算，定期上报省财政厅和农业综合开发领导小组办公室。无偿投放的农业发展基金年终如有结余，结转下年继续使用。
２、农发基金有偿投放用于农业综合开发项目部分，由市县财政统一管理，搞好承借承还。还款期限，一般应在借款二年以后开始回收，对到期不还的，市县财政负责归还。有偿扶持资金一律不收占用费。有偿投放比例最高不得超过借款总额的６０％。收回的有偿扶持资金，属于国家和省级的农发基金借款存入省农业综合开发领导小组办公室专户；属于市县级的，存入市县财政支农周转金专户，继续用于农业综合开发。
３、农业综合开发资金使用实行按效益定项目，按项目定投资，不搞按行业、按市县分条切块。资金投放要体现政府行为，体现国家支援农业的政策，树立三个效益观念（即经济效益、社会效益、生态效益）。
４、农业综合开发资金拨付，与耕地占用税、预算调节基金收入进度挂钩，与农业发展基金预算安排落实情况挂钩，与配套资金落实情况挂钩，与项目完成和借款加收情况挂钩。当年配套资金没有落实或到期借款不上交的，相应扣减省级拨款。有条件的地方可以实行配套资金先存后用的办法，即先把配套资金存入银行，由银行开具存款数额证明，交验后再拨（借）款。下拨的农业综合开发资金，存入当地农业银行或信用社。
市、县以下农业综合开发子项目拨款，要根据工程项目性质，留１０－２０％的工程承包费，待工程竣工验收合格后结算补齐。
５、农业银行的专项贷款，由农业银行根据批准的项目计划，按农行贷款管理办法办理。有的开发项目，农业发展基金可以与贷款结合安排，但不要每个具体项目都搞“拼盘”。农业银行专项贷款回收后，继续用于综合开发。
６、农业综合开发项目投资，要按项目实行独立核算，项目建设单位要对项目资金和物资做到专款专用，专物专用，建立健全资金物资的领报、核算管理手续制度，按规定编报财务会计报表。开发市县的审计、财政和业务主管部门，要加强对项目建设单位的财务监督检查。
（四）物资管理。农业综合开发资金和贷款所需统配物资，列入各级物资供应计划；用于农业开发的物资，任何单位或个人不准截留挪用。
（五）组织领导。农业综合开发的组织领导，实行市县政府承包实施与业务主管部门行业规划指导、科技咨询服务相结合，即条块结合，以块为主。有关开发项目的规划、设计等前期工作，要注重发挥行业主管部门的业务指导作用；项目实施过程中，要以市县政府行政领导为主。凡立项开发的市县，都要由市县政府领导牵头，从计划、财政、银行、农业、水利、林业、农机、土地、畜牧等有关部门抽调得力人员，负责开发项目实施过程中的各项工作。
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