特殊病种门诊治疗的医疗费用总量÷合肥地区预测参保人员特殊病种的发病人数。
出院人均次费用定额预付标准计算公式为：
（住院治疗医疗费用总量÷合肥地区预测参保人员住院总人次）×Ｃｉ
其中Ｃｉ为不同级别定点医疗机构的出院人次费用调节系数，医保运行初期，暂定Ｃｉ标准为：一级及一级以下医院Ｃｉ＝０．５；二级医院Ｃｉ＝０．７５；三级医院Ｃｉ＝１．１５。
医疗保险经办机构于每月１５日前按照以下公式向各定点医疗机构预付上月属统筹基金支付的医疗费用：
特殊病种门诊治疗年人均费用定额预付标准÷１２×在该定点医疗机构治疗特殊病种人数＋出院人均次费用定额预付标准×月出院人次
参保人员在定点医疗机构就医发生的医疗费用中按规定属个人自付的部分由定点医疗机构直接向参保人员收取。
年终决算
年终劳动保障部门会同财政、卫生等有关部门，根据当年实际筹集的统筹基金数额、急诊统筹医疗费用的实际支出数额、异地安置人员统筹医疗费用实际支出数额、异地转院（诊）统筹医疗费用的实际支出数额，特殊病种的实际人数、年实际出院人次，确定特殊病种门诊治疗年人均费用定额标准和出院人均次费用定额标准，并按此标准与定点医疗机构决算。预付给定点医疗机构的医疗费用数额大于决算数额的，差额部分在下一年度预付数额中予以扣除。
三、结算程序
（一）住院及特殊病种门诊治疗的结算程序
定点医疗机构于每月５日前，将上月出院患者的姓名、医保号、详细的医疗收费清单等资料报医疗保险经办机构，医疗保险经办机构审核后，作为每月预拨及年终决算的依据。
医疗保险经办机构于每月１５日前按本办法预拨上月的住院及特殊病种门诊治疗的统筹费用。特殊病种的管理办法另行制定。
经认定患有特殊疾病的参保人员本着就近分散的原则，选择一家定点医疗机构作为本人特殊疾病门诊治疗的定点医院。患有特殊疾病的参保人员在本人选择的定点医疗机构门诊治疗发生的医疗费用，由定点医疗机构按比照一次住院处理的规定与参保人员结算。
（二）急诊结算程序
参保人员因急诊抢救到市内非定点的公立医疗机构及异地公立医疗机构住院治疗，发生的医疗费用，先由个人或单位垫付，急诊抢救终结后，凭医疗急诊病历、检查、化验报告单、发票、详细的医疗收费清单等到医疗保险经办机构按规定办理报销手续。急诊医疗费用管理办法另行制定。
（三）异地安置人员结算程序
