直接从地下取水进行封闭循环使用后，又回补原水源且对水源不造成危害的，其回补部分免缴水资源费。
开采矿泉水、地热水，用于商业经营的企事业单位，已经缴纳矿泉水、地热水的采矿权使用费和矿产资源补偿费的，不再缴纳水资源费。
第二十七条 县级以上水行政主管部门按下列规定分级征收水资源费：
（一）直接从河道中取水的，由主管该河道（河段）的水行政主管部门征收水资源费；
（二）直接从地下取水，日取水量在１００００立方米（含１００００立方米）以上的，由省水行政主管部门征收水资源费；日取水量在５０００至１００００立方米（含５０００立方米）或者直接从地下取水为省辖市供水的，由省辖市水行政主管部门征收水资源费；
（三）本条（一）、（二）项规定以外的其他取水由取水口所在地的县（市、区）水行政主管部门征收水资源费。取水口所在地未设立县级水行政主管部门的，由省辖市水行政主管部门直接征收水资源费。
第二十八条 水资源费的征收标准，本着促进节约用水和保护水资源的原则，由省价格、财政部门会同省水行政主管部门根据水资源的用途及各地的丰缺情况制定和调整。
第二十九条 各级水行政主管部门在收费前应当到当地价格部门申领收费许可证，并使用省财政部门印制或监制的票据。
第三十条 水资源费按实际取水量计征。除农业灌溉取水外，其他取水工程或设施均应安装计量设施，无计量设施的，水行政主管部门应当责令取水人在规定期限内安装计量设施，逾期不安装的，按取水工程或设施最大取水量每日运转２４小时计算取水量。
农业灌溉取水工程或设施无计量设施的，按照其设计取水能力和实际运行时间计算取水量。
第三十一条 取水人应当按照取水许可证批准的取水量取水。凡超批准取水量在３０％（含３０％）以内的，其超过部分按原标准加１倍征收；超批准取水量在３０％－５０％（含５０％）的，其超过部分按原标准加２倍征收；超批准取水量５０％以上的或者未经批准擅自取水的，其超过部分或者擅自取水部分按原标准加３倍征收。
第三十二条 水资源费按月征收。取水人应当在每月１０日前结缴上一个月的水资源费，有特殊情况的，经征收机关批准可以缓缴，但７月３１日前必须结清上半年的水资源费，１月３１日前必须结清上一年度的水资源费。
