第十二条 预算的执行。事业单位编报的预算，一经主管部门或财政部门批准，即成为预算执行及预算拨款的依据。除上级下达的事业计划，工作任务有大的调整或根据国家政策，机构、人员发生大的变化，对预算影响较大，需要报请主管部门或财政部门核准调整预算外，一般不办理追加减预算。在年度预算执行过程中，收入计划需要调增调减的，可相应调增调减支出计划。事业单位应定期对预算执行情况进行分析，并向主管部门或财政部门报送有关情况和资料。
事业单位收入年终实际数大于或小于年初预算数，做为调整预算处理。
第十三条 决算的编制。事业单位在预算年度终了，应认真总结，分析年度预算执行情况及存在的问题，提出改进意见，并按财政部门和主管部门的要求，及时准确地编制单位年度决算，报主管部门及财政部门审批。
第十四条 预算收支结余的计算和分配。事业单位预算拨款数与收入数大于决算支出部分，为预算结余数，结转下年继续使用。
事业单位的年终预算收支结余，扣除专项资金结余后，应按有关规定提取事业发展基金，职工福利基金和职工奖励基金。其中，事业发展基金一般不低于４０％。三项基金的具体提取比例由主管部门会同同级财政部门核定。（按规定实行新的财务制度提取公积金、公益金的事业单位，按照新的财务制度的规定执行。）国家优惠政策而减免的各项税金、基金，应如数提出并全部转入事业发展基金。
第十五条 收入管理原则：
（一）事业单位应在国家法律、法规和政策规定允许的范围内，充分利用单位的人才、技术、设备等条件，挖掘潜力，广开财源、积极合理地组织收入。
（二）事业单位组织收入，必须将社会效益放在首位。开展组织收入活动必需有利于事业发展，有利于丰富人民物质文化生活，有利于社会主义精神文明建设，在获得社会效益的同时获得较好的经济效益。
（三）事业单位组织收入，必须严格执行国家有关行政事业性收费政策及管理制度，按照国家规定的收费范围和标准合理收费，增减收费项目，调整收费标准必须按规定报批。各种收入都必须交由单位财务部门入帐。
第十六条 事业单位的各项收入，以及附属的独立核算的经营服务单位上缴的收入，全部纳入预算内，与财政拨款统一核算、管理。
