县（市、区）政府要对所辖乡（镇）农民负担工作进行全面检查。要检查乡（镇）、村是否按要求进行了自查；群众举报了哪些问题，解决了哪些问题，遗留的是哪些问题。对群众反映的重点问题，要抓紧解决。要着重抓好提留统筹费“一定三年不变”、税收征管、教育集资、中小学收费、报刊征订、农村电价、精简不在编人员等重点问题的检查和有关政策的落实。要组织本级政府部门涉农收费、集资、达标等情况的检查清理，各有关部门要将收费项目的名称、标准、范围和批准单位的文件、文号，以及收取的金额和使用管理情况等向县级政府写出报告。县级政府要将有关部门清理项目的情况逐一汇总，并提出审核处理意见，报上一级政府。
县级检查组要深入乡（镇）、村和农户，广泛听取基层干部和农民群众的意见，掌握第一手资料并负责地向县（市、区）政府作出汇报。县级政府要对各乡（镇）和有关部门减轻农民负担工作的态度、抓减轻农民负担工作的力度及实际表现进行考察，作为考核和任用干部的重要依据。检查结束后，县级政府要向地市政府（行署）写出检查报告。
（三）省、地进行抽查
省、地两级对各县（市、区）农民负担检查工作进行抽查，地区对县级的抽查不少于１／３，省上对县级的抽查不少于１／１０，要按经济发展的水平，每个县（市、区）随机抽查３个乡（镇），每个乡（镇）抽查３个村，每村至少要抽查１０个农户。发生严重事件和恶性案件的县（市、区）都要列入抽查范围。重点抽查县、乡（镇）、村是否按照中央和省、地（市）的部署，认真开展了减轻农民负担检查工作；群众反映的突出问题是什么，是否按党政一把手负责制和专项治理部门责任制进行解决，还有哪些问题没有解决。对乡（镇）一级检查的重点问题要进行分类排队和分析，提出整改措施；对县一级的行政事业性收费项目要与省一级掌握的情况相对照，发现非法项目要立即明令取消；各种名目的乱集资和达标升级活动要坚决停下来；涉及农民负担的恶性案件要依法从快从严查处。
地市政府（行署）要组织对本级部门涉农收费、集资、达标情况进行检查清理，各有关部门要将检查清理的情况向本级政府写出报告。全省收费、集资、达标项目的清理情况汇总后，按照国办发〔１９９９〕６５号文件的规定，该取消的取消，该停收的停收，能降低标准的要降低标准，并向农民和社会公布。
五、检查的方式
检查工作总的要求是深入、具体，到村到户，不走过场。要采取明查与暗访相结合，政府统一检查与部门自查自纠相结合，并采取召开座谈会、财务查帐、设置举报箱、入户问卷调查等方式进行。抽查时，一律不准事先打招呼。要坚持边查边纠的工作方针，对发现的问题，各级政府和有关部门要限期解决，处理结果要逐级上报，并向农民公开。对违反有关政策规定向农民多收、滥收费用的，要按规定退还或扣减，对有关责任人要给予批评，情节严重的要给予纪律处分，并视情节依法给予处罚；对造成严重后果、触犯刑律的，移交司法机关依法查处；对因加重农民负担引发严重事件和恶性案件的，要严肃处理直接责任人，并追究有关县级主要领导人的责任。
六、检查时间的安排
