“被占用的基本农田，经县级以上人民政府勘测认定其耕作层土壤有条件再利用的，占用单位应当按照农业行政主管部门和土地行政主管部门制定的耕作层土壤再利用方案，将所占用基本农田耕作层的土壤用于新开垦耕地、劣质地或者其他耕地的土壤改良。”
十一、第十四条改为第十三条，修改为：“禁止任何单位和个人闲置、荒芜基本农田。经国务院批准的重点建设项目占用基本农田，闲置一年以上未动工建设的，由县级以上人民政府土地行政主管部门按照每平方米六元以上十元以下的标准收取闲置费；可以耕种并收获的，由原耕种该幅基本农田的集体或者个人恢复耕种，也可以由用地单位组织耕种；连续两年未使用的，经国务院批准，由县级以上人民政府无偿收回用地单位的土地使用权；该幅土地原为农民集体所有的，应当交由原农村集体经济组织恢复耕种，重新划入基本农田保护区。”
十二、第十五条改为第十四条，修改为：“承包经营基本农田的单位或者个人连续两年弃耕抛荒的，原发包单位应当终止承包合同，收回发包的基本农田，并组织恢复耕种。”
十三、第十六条改为第十五条，修改为：“排放污染物污染基本农田的，由县级以上人民政府环境保护行政主管部门依法处理。”
十四、第十七条改为第十六条，修改为：“县级以上人民政府土地行政主管部门收取的占用基本农田闲置费，一律上缴财政，作为基本农田建设专项经费，专款用于新的基本农田的建设和中低产田的改造。
“各级人民政府对开垦、开发、保护基本农田有贡献的单位和个人，应当给予奖励。”
十五、第十八条改为第十七条，增加一款作为第二款：“县级人民政府农业行政主管部门应当会同土地行政主管部门按照国家有关规定，制订农田地力分等定级办法，报本级人民政府批准后组织实施。”
十六、第二十条改为第十九条，修改为：“禁止在基本农田保护区建窑、建房、建坟、挖砂、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他破坏基本农田的活动。
“违反前款规定，破坏基本农田、毁坏种植条件的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令限期改正或者治理，恢复原种植条件，处占用基本农田的耕地开垦费一倍以上二倍以下的罚款。在基本农田保护区建房和其他设施的，县级以上人民政府土地行政主管部门有权制止，责令限期拆除；逾期不拆除的，由县级以上人民政府土地行政主管部门申请人民法院强制执行。”
