第五条 项目前期工作经费按分级负责的原则安排。长江干流及四水治理由省计委商省财政厅、省水利水电厅安排，其他项目由当地政府另行安排，不得从专项资金中列支。工程设计费用由省计委会同省财政厅、省水利水电厅按照国家有关规定从紧核定，不得突破。
第六条 水利项目专项资金的投资计划由各级计划、财政、水利部门向上级计划、财政、水利部门联合申报。其中湘资沅澧四水治理项目由省计委会同省水利水电厅、省财政厅按突出重点的原则先提出安排意见，项目所在地计划、财政、水利部门据此联合上报建设计划。
第七条 专项资金总体安排方案由省计委根据国家计划并结合地市州上报的计划会同省财政厅、省水利水电厅提出，报省人民政府审定。具体到子项目的投资计划由省计委按照省人民政府审定的方案会同省财政厅、省水利水电厅联合下达。其中重点项目（项目名单由省计委商有关部门确定）将根据工程进展情况分批下达。
第八条 为加强项目管理，投资较大的岳阳、益阳、常德等地市要成立由计划部门牵头，财政和水利等部门参加的水利项目建设管理办公室，具体负责项目申报和实施。
第九条 项目所在地计委要会同财政、水利部门根据省下达的计划，编制项目具体实施计划，报上级计划、财政、水利部门备案。
第三章 资金管理
第十条 专项资金地方部分的债务由省、地（市、州）、县（市）分级承担。其中江垭水利枢纽工程全部由省有关公司承担；洞庭湖治理（含蓄洪区安全建设）由省承担３０％，地（市）、县（市）承担７０％；长江治理及长江干堤除险加固由省承担６０％，市、县（市）承担４０％；病险库治理、湘资沅澧四水治理、大型灌区续建配套项目由省承担３０％，地（市）、县（市）承担７０％；城市防洪与其他项目全部由地（市、州）、县（市）承担。
第十一条 地（市、州）与县（市）债务分担比例由地区行署、市州人民政府确定，报省计委、省财政厅、省水利水电厅备案。由地（市、州）、县（市）以及省直有关部门、单位承担的债务，由省财政厅分别与地区行署、市州人民政府、省直有关部门与单位签定《转贷国债资金协议》，明确转贷数额、转贷期限、转贷利率、还款承诺、违约处罚等内容。
第十二条 各级财政部门和项目实施单位必须设立专项资金专户，专帐核算，按基本建设财务规定管理，提高资金使用效益。
