（四）综合定额加专项补助，对综合定额部分实行预算包干。综合定额部分包括基本工资、补助工资、其他工资、职工福利费、社会保障费、助学金、公务费、设备购置费、修缮费、业务费、其他费用等，综合定额的具体标准由同级财政部门和事业单位主管部门根据单位实际和财力可能确定。
专项补助主要指根据单位事业特点、事业发展计划、国家财政政策及财力可能，对大型修缮和设备购置等支出给予的不同程度的补助。
（五）经费分配“零基预算”法。即根据事业单位的性质、计划及任务，综合事业单位财务收支状况，每年从零开始重新核定财政补助数额。财政部门根据单位职工人数，按照国家规定标准确定人员经费补助数额；按照单位业务工作需要，并结合物价水平，确定公务费、业务费补助数额；根据单位房屋建筑物面积、设备状况、车辆数量等情况确定修缮费补助数额。
（六）定项补助，一年一定。即根据事业单位收支情况，区别不同情况，对事业单位的某项支出核定财政补助数额。
第十二条 少数事业单位因占有较多国家资源或国有资产、享受国家特殊政策、以及收支归集配比不清等而取得较多收入，超出其正常支出较多的，实行收入上缴办法。具体办法由同级财政部门会同此类事业单位主管部门制定。
收入上缴方式可以采取定额上缴法和按比例上缴法。定额上缴法即在核定预算时，确定上缴的绝对数额；按比例上缴法即根据收支情况，确定按收入上缴的比例。
收入上缴时间可以在预算年度执行过程中，按月或按季上缴，或者年终一次性上缴。
第十三条 事业单位预算编制要正确体现和贯彻国家有关方针、政策和规章制度，坚持量入为出、收支平衡的总原则。收入预算坚持积极稳妥的原则，支出预算坚持统筹兼顾、保证重点、勤俭节约的原则。
第十四条 各事业单位要正确领会上级有关部门对事业单位预算编制的有关要求，在总结、分析上年度预算执行情况，掌握财务收支和业务活动及有关资料变化情况的基础上，找出影响本期预算的各种因素，剔除上年一次性或临时性因素，考虑本年度事业计划对预算的要求，及本年度国家有关政策对预算的影响，正确编制单位预算。预算必须自求收支平衡，不得编制赤字预算。
第十五条 事业单位结合本单位具体情况，参照当年财政核定的收支预算，提出本单位下年度的包括申请财政补助建议数（需附文字说明）在内的全部收入、支出预算建议数，并按财务管理权限，逐级上报审核汇总；主管部门将汇总的预算于１１月１５日以前报财政部门审核，财政部门经平衡后下达预算控制数。
事业单位根据财政部门或其主管部门下达的预算控制数编制正式预算，由主管部门汇总报同级财政部门审批。财政部门根据同级人民代表大会批准的本级预算，在规定期限内批复下达部门和单位的预算。
第十六条 经常性收入预算应参考当年或以前年度预算执行情况，根据预算年度的增减因素测算编制，其中申请财政补助数参照当年财政部门核定的补助标准编制。
专项资金收入预算应按照财政部门在年初和年度预算执行当中批复的有指定项目用途的预算，根据单位实际情况和结转下年度的专项资金结余，并考虑下年度开展专项活动的需要编制。
按规定必须列入单位预算的收入（包括财政预算拨款、财政核拨的预算外收入和事业单位组织的其他收入），必须如实反映，不得隐瞒、少列。
第十七条 支出预算应根据单位事业发展需要与财力可能测算、编制；上缴数额按规定的比例或数额编制。
第十八条 事业单位预算在执行过程中，国家对财政补助收入和从财政专户核拨的预算外资金一般不予调整。如果国家有关政策或事业计划有较大调整，对收支预算影响较大，确需调整时，事业单位可以按规定程序报请主管部门或者财政部门调整预算。其中收入项目需要调整的，由单位自行调整并报主管部门和财政部门备案。
收入预算调整后，相应调整支出预算。
