十八、第三十九条改为第四十二条，第一款修改为：“属本条例第三十九条第一款第（一）项用地的，土地使用者应当在出让合同生效当日交付土地使用权出让金总额３０％的首期款，余额应在出让合同生效之日起三十日内付清；经土地管理部门同意并在出让合同中注明，余额可以延期交付，但最长不得超过一年。逾期未付清的，土地管理部门依照本条例第二十条的规定处理。”
第二款、第三款中的“第三十六条”修改为“第三十九条”。
十九、第四十一条第一款“依本条例第三十六条第一款第（一）项规定减收地价款取得土地使用权的”中的“地价款”修改为“土地使用权出让金”，本条中其他的“地价款”修改为“土地使用权出让金和土地开发与市政配套设施金”。
二十、第四十六条改为第四十九条，第（四）项后增加一项作为第（五）项：“（五）用地单位迁移或者被依法注销的；”。
第（五）项、第（六）项分别改为第（六）项、第（七）项。
二十一、第四十九条改为第五十二条，增加一款为第二款：“本条例第四十九条第（二）、（三）、（四）、（五）、（六）项规定的情形，由市政府房地产主管部门径为注销登记。”
二十二、第七章的题目修改为：“法律责任”。
二十三、在第五十二条前增加一条为第五十五条：“第五十五条 违反本条例第三条规定，擅自出让土地使用权的，出让合同无效，土地管理部门可以依据《
深圳经济特区房地产转让条例》的有关规定对有关当事人的违法转让行为予以处罚。”
二十四、第五十二条改为第五十六条，第一款修改为：“违反本条例第二十一条规定，土地使用者未按出让合同规定的用途和条件开发利用土地的，土地管理部门应予限期纠正，并可处以土地使用权出让金总额２０％的罚款。拒不纠正的，土地管理部门无偿收回土地使用权，没收地上建筑物、附着物。”
第二款修改为：“土地使用者逾期未完成地上建筑物的，土地管理部门自出让合同规定的项目竣工提交验收之日起处以罚款。逾期六个月以内的，处以土地使用权出让金总额５％的罚款；逾期六个月以上一年以内的，处以土地使用权出让金总额１０％的罚款；逾期一年以上二年以内的，处以土地使用权出让金总额１５％的罚款；逾期二年仍未完成地上建筑物的，土地管理部门无偿收回土地使用权，没收地上建筑物、附着物。”
增加两款，作为第四款、第五款：
