第十八条 运行机制。省的重点实验室实行开放、流动、联合的运行管理机制，有条件的实验室可以报请主管部门批准实行边建设、边开放。建成验收后的实验室必须面向全省乃至全国开放，并对省和国家自然科学基金委员会资助或推荐的研究项目优先开放。
第十九条 实验室主任聘任制。实验室建成后，要成为相对独立的科研实体，由主管部门聘任主任一人，全权负责实验室的工作，任期由主管部门决定。主管部门对在任职期间需外出超过半年以上的实验室主任，应及时调整。
第二十条 学术委员会。实验室必须设独立的学术委员会，它是实验室的学术领导机构，其主要职能是决定实验室的研究方向，审定研究课题，监督经费使用，协助开放事宜，组织论文答辩及成果评价。学术委员会人员总数一般不超过１５人，超过１５人的应报管委会批准。学术委员会应尽可以吸收外部门相关学科的学术造诣较深的专家参加，本单位的专家不应超过三分之一。联合实验室的学术委员会，各联合单位的专家不超过二分之一。
第二十一条 科技人员编制。主管部门和承担单位应核定实验室的固定研究人员及技术人员编制，要特别注意采取特殊政策稳定实验室的固定技术队伍，以保证实验室的开放与运行。为促进科技人员的流动和学科的相互渗透，实验室固定研究人员编制不应超过参加研究工作人数的半数，大部分应为客座研究人员。要注意吸收和培养青年科技人才，并要努力吸收学有成就的出国留学、进修人员回国参加实验研究工作
第二十二条 经费。实验室的经常费用（包括基本运行费用）要由部门事业费支出，部分可从申请获得的省和国家自然科学基金项目所含的实验研究费用支出。对评估合格的实验室，应将其实验研究指南纳入省自然科学基金项目指南。基金项目的实验研究费主要投向重点实验室的运行，一般情况下对研究项目不再单独审批实验仪器设备购置费。实验室应在向社会开放的环境中，通过自己工作质量和研究水平的竞争获得经费资助以求得到自身发展。省财政厅根据省财力情况给予一定的资助。
第二十三条 评估。对验收后已开放三年以上的实验室，管委会应组织专家进行评估，并将评估结果对外公布。在学术上或在促进技术进步方面对全省做出重大贡献、能够集聚和培养人才，在国内或国际上有影响的实验室，省财政将根据财力加强资助以提高其科研能力，或申请国家资助，使之逐步发展成为国家重点实验室。对连续两次评估不合格的实验室，或长期建设不能开放和发挥作用的实验室，将取消其作为全省重点实验室的资格，管委会有权调动其已装备的大型科研仪器设备，或通过其它方式进行处理。
