第六条 市、县、自治县筹集的水利建设基金的６０％上缴，纳入省水利建设基金；４０％留归市、县、自治县。
市、县、自治县出租、出售国有水利设施收回的资金，水利建设基金使用获得的收益和收回的资金以及市、县、自治县用于水利建设的其他专项资金，全部留归市、县、自治县。
第七条 市、县、自治县水利部门应当按季度将筹集的水利建设基金缴到同级财政部门。市、县、自治县财政部门应当按季度按比例将筹集的水利建设基金上缴到省财政部门。
水利建设基金纳入财政预算管理，专户储存，专款专用，年终结余可结转下年安排使用。
第八条 省水利建设基金用于大、中型水利工程的建设、改造以及有重点防洪任务的城市防洪与治理；市、县、自治县水利建设基金用于小型水利工程的建设、改造以及防洪整治工程。
从国家以工代赈资金中筹集的水利建设基金，只能用于中、小（一）型水库建设。
从农业综合开发资金中筹集的水利建设基金，只能用于支、斗渠道建设。
第九条 水利部门根据水利建设规划，每年年初向同级财政部门报送年度水利建设基金使用计划，经同级财政部门审核后拨付资金。其中，属于水利基建工程的，由计划部门会同有关部门严格审查后报省政府批准，纳入省基建投资计划，按基建程序办理。
第十条 财政部门应当建立健全水利建设基金的收支核算和日常管理制度。水利部门每年年终应当按财政隶属关系编制水利建设基金收支决算报表；属于基本建设的支出，应当按规定编制基本建设财务决算，报送同级财政部门审批。
第十一条 经营性水利建设项目使用水利建设基金的，由建设单位与水利部门签订水利建设基金有偿使用合同，每年收取４％的管理费。在工程竣工验收投产后，水利部门应当在１５年内分期收回所有资金。
第十二条 基础性、公益性水利建设项目使用水利建设基金的，由建设单位与水利部门签订水利建设基金使用合同，根据工程实际效益收回部分资金。
第十三条 水利部门可依法按投资入股的方式将部分水利建设基金直接投资于供水工程。
