对违反本办法规定的船舶和单位，由港务监督按下列规定给予处罚：
（一）未按规定配置防污染结构和设备或者擅自拆除、停用防污染设备的，责令限期改正，并处以1000元以上4000元以下的罚款。
（二）未按规定持有船舶防污证书的，责令补办有关手续，并处以200元以上1000元以下的罚款。
（三）未按规定如实记载各项作业情况的，责令限期改正，并处以200元以上1000元以下的罚款。
（四）船舶发生污染水域事故，虽采取控制或者减轻污染损害的措施，但未按规定向港务监督报告情况的，处以1万元以上3万元以下的罚款；船舶发生污染水域事故，不向港务监督报告，也不采取控制或者减轻污染损害措施的，处以3万元以上5万元以下的罚款。
（五）擅自排放压舱水、洗舱水或者舱底水的，责令停止排放，并处以4000元以上1万元以下的罚款。
（六）任意向水域倾倒船舶垃圾的，责令限期清除，并处以1000元以上4000元以下的罚款。
（七）冲洗甲板不符合规定的，责令停止作业，并可处以400元以上4000元以下的罚款；擅自冲洗装载有毒有害货物船舶的甲板造成水域污染的，责令停止作业，并处以3万元以上5万元以下的罚款。
（八）擅自从事船舶洗舱作业的，责令停止作业，补办有关手续，并处以500元以上1000元以下的罚款；擅自从事原油洗舱作业的，责令停止作业、补办有关手续，并处以1万元以上3万元以下的罚款。
（九）运输、装卸作业中未按规定合理积载、隔离货物或者未按规定采取防泄漏、防扬散、防散落措施的，责令限期改正，并处以200元以上1000元以下的罚款。
（十）擅自使用化学消油剂的，责令立即停止使用，并处以200元以上1000元以下的罚款。
对违反本办法规定排放残油、废油、货物残渣或者其他有毒有害物质造成水域污染的船舶和单位，由港务监督按照国家有关规定予以处罚。
第二十九条 （直接责任人员的追究）
对违反本办法规定造成水域污染的直接责任人员，由港务监督处以个人月基本工资20％以下的罚款；情节严重的，由所在单位或者上级主管部门给予行政处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
第三十条 （污染损害的赔偿）
违反本办法规定造成水域污染事故的船舶和单位，有责任排除污染危害或者承担相应的污染清除费用，并向受到污染损害的单位或者个人赔偿损失。
当事人对赔偿责任和赔偿金额发生纠纷的，可以申请港务监督调解处理，也可以依法向人民法院提起诉讼。
