《驻深运输证》办理程序如下：
（一）向车籍所在地交通运输管理部门申领批准文件；
（二）持上述批准文件及与深圳货主或运输服务营业机构签订的运输合同意向书，向货物起运地交通运输管理部门提出申请；
（三）受理申请的交通运输管理部门根据货运市场需求及货运场站等情况，自收到申请之日起十五日内，决定是否颁发《驻深运输证》；对不予发证的，应书面答复申请人。
第二十五条 深圳货主及运输服务营业机构不得雇佣未按本规定办理《驻深运输证》、《异地机动车辆登记证》、《异地驾驶员登记证》的异地营运货车及异地驾驶员。
第二十六条 异地营运货车在深圳运输余泥渣土的，除按本规定有关条款执行外，还应到深圳市余泥渣土排放管理部门申领余泥渣土准运证。
第二十七条 持《驻深运输证》的异地营运货车，在经营活动中应使用深圳市税务管理部门规定的发票并依法纳税。
第四章 罚则
第二十八条 深圳市公安交通管理部门对违反本规定第二章有关条款的，应分别按交通违章予以处罚。
对违反本规定第十三条的，除依照《
中华人民共和国治安管理处罚条例》的规定处罚外，还应吊销《异地机动车辆登记证》、《异地驾驶员登记证》。
第二十九条 深圳市交通运输管理部门对违反本规定第十六条至第二十五条的，应没收其非法所得并可视不同情况处以下列罚款：
（一）违反本规定第十六条、第二十四条的第一款的，处以五千元罚款；
（二）违反本规定第十七条第一款、第二十五条的，处以一千元至一千五百元罚款；再次违反的，处以三千元罚款；
（三）违反本规定第十八条、第十九条、第二十条的，处以五百元至一千元罚款；
（四）违反本规定第二十一条、第二十三条的，处以一百元至五百元罚款。
第三十条 深圳市城市管理部门对违反本规定第二十六条的，深圳市税务管理部门对违反本规定第二十七条的，应分别根据有关规定予以处罚。
第三十一条 被处罚者对市主管部门作出的处罚决定不服的，可依法向深圳市人民政府行政复议机构申请复议；对复议决定不服的，可以自接到复议决定书之日起十五日内依法向人民法院起诉。逾期不申请复议或不向人民法院起诉、又不履行处罚决定的，由作出处罚决定的部门申请人民法院强制执行。
