（一）申请使用省级基金，经单位主管部门和项目所在市环境保护部门审核同意，省环境保护部门委托的银行核实偿还能力后，由省环境保护部门审批（中央、省直属单位直接向省环境保护部门申请）。
（二）申请使用市、县级基金，经单位主管部门预审，市、县环境保护部门委托的银行核实偿还能力后，由市、县环境保护部门审批。
申请使用基金的单位主管部门，可以根据本部门的实际情况，审核所属单位的贷款申请后，统一报请批准。
无主管部门的单位，可以直接向环境保护部门提出申请。
第十三条 贷款申请批准后，贷款使用单位应当将项目所需自筹资金存入环境保护部门委托的银行，由银行同贷款使用单位签订贷款合同，并按合同发放贷款。银行应当监督贷款的使用，催收本息，并按季向环境保护部门报送贷款发放、回收报表。
第十四条 基金的贷款期限不得超过三年。贷款利率按国务院《
污染源治理专项基金有偿使用暂行办法》规定执行，并可按中国人民银行同期利率增长幅度增加，贷款利息按季结清。
第十五条 贷款使用单位终止贷款合同的，贷款银行应当追回全部贷款，并按占用基金月数计收利息。
第十六条 贷款使用单位使用贷款项目完成后，应当向负责审批贷款项目的环境保护部门提交项目验收申请报告。
第十七条 环境保护部门可以根据贷款项目完成情况，按下列规定对贷款使用单位豁免一定数额的贷款本金。豁免的数额不得高于其历年纳入基金总额扣除历次豁免额后的余额：
（一）项目按期完成，质量达到设计标准，在试投产或者试运行期内保持正常运转的，可按最高豁免额的100％豁免贷款本金；
（二）项目未按期完成，但质量达到设计标准，在试投产或者运行期内保持正常运转的，可按最高豁免额的80％豁免贷款本金；
（三）项目按期完成，但质量未达到设计标准，经限期整改后，质量达到设计标准的，可按最高豁免额的60％豁免贷款本金。
第十八条 贷款利息不予豁免，由贷款使用单位从自有资金中偿还。但环境效益、经济效益、社会效益显著的重点污染源治理项目、污染源治理示范项目、治理污染源的科技攻关项目，可给予贴息。贴息额度为应交利息的10％至30％。
