县和县以下的全民所有制科研单位，也可以实行国家所有、集体经营、独立核算、自负盈亏的集体经济管理办法。
三、实行所长负责制。实行所长负责的单位，所长由上级主管部门任命或职工选举后报上级批准，并实行任期制；副所长由所长提名，上级主管部门批准；科室中层领导，由所长任免。实行所长负责制的单位，所长上对主管部门负责，下对所里负有全面领导责任，拥有行政、业务工作的一切权力。所长有权决定全所的机构设置、科研课题、财务计划和物资调配，有权择优录用、招聘和雇用单位所需要的人员，辞退不称职人员，处分和开除违纪人员，有权确定奖励形式、工资形式和进行自费工资改革。
实行所长负责制的单位，上级主管部门务必选任好所长。暂不实行所长负责制的单位，要抓紧进行整顿工作，为实行所长负责制积极创造条件。科研单位必须由内行当家，领导班子成员中大专以上文化程度和有中级以上技术职称的人员要占三分之二以上，平均年龄不超过五十五岁。
实行所长负责制的科研单位成立党组。党组主要负责实现党的方针政策，团结非党干部和群众完成党和国家交给的任务，指导本单位党组织的工作。
这项改革，今年可先在推行有偿合同制的单位试点，然后逐步推开。暂不实行所长负责制的单位，要明确党政分工，进一步扩大所长全面领导行政、业务工作的责任。
四、实行课题承包制。科研单位对内都要实行课题承包责任制，经费按课题核算，进行包干。课题组长由群众推荐，所长决定；参加人员由课题组长提名组建，所长批准。科研单位内部的科研管理、行政、后勤等工作，也要实行岗位责任制或承包责任制。
五、扩大科研单位的财权。试行有偿合同制的单位其纯收入不上交，按照与上级主管部门商定的比例，分别用于建立本单位的科技发展基金、集体福利基金与奖励基金。暂不实行有偿合同制的单位和其他不实行有偿合同制的单位，通过参加科研生产联合体、接受委托科研项目、转让成果和提供科技服务取得的纯收入也不上交，暂按百分之六十留作科技发展基金，百分之二十留作集体福利基金，百分之十五留作奖励基金，百分之五直接奖给获得收入的有功人员。
科研单位出售试制的科技新产品和小批量中试产品，三年内免征工商税和所得税；出口收入的外汇，全部留用。
科研单位根据事业发展需要和财力可能，有权购置科研所必须的仪器、设备和原材料，不受社会集团购买力的限制。
