渔政部门应制订并组织实施防止渔业生产活动对黄浦江上游水源污染的管理办法；参加渔业生产所造成的水污染事故调查处理；配合港航监督机关对渔业船舶排污的监督管理。
卫生部门应参加黄浦江上游地区新建、扩建、改建工程有关卫生防护设施的三同时审查，并参与有关重大污染事件的调查。
公用部门应对水厂进水口和出厂水水质进行定期监测，并向环保部门提供监测数据。
第九条 各级人民政府应责成企事业单位的主管部门和计划、规划、环保等部门严格执行本
《条例》。采取切实有效的措施，对水源保护区和准水源保护区内原已形成的水污染，采取限期治理措施，逐年减少排污量，并严格防止新的水污染。
第二章 监督和管理
第十条 黄浦江上游地区的排污单位，在新的三废排放标准颁发之前，暂执行原排放标准。
第十一条 水源保护区、准水源保护区的污染物允许排放总量由市环保局确定。各区、县属水源保护区和准水源保护区范围内各排污单位允许的排污量之和为该地区的污染物允许排放总量。
污染物排放浓度尚未达到规定标准的排污单位必须以一九八二年污染物排放量为基数，削减百分之五十至百分之七十；没有一九八二年数据的，以一九八五年污染物排放量为基数，削减百分之五十至七十。对污染物排放浓度已达到规定标准的排污单位暂不提出削减要求。
第十二条 在污染物实际排放总量低于允许排放总量且水质达到水源保护规定的水环境质量标准的地区，各区、县可适当发展一些污染少的项目，但不得新建石棉制品、土硫磺、电镀、制革、造纸制浆、土炼焦、漂染、炼油、有色金属冶炼、土磷肥和染料之类小化工等污染严重的生产项目；不得建设油类和危险品作业码头以及拆船厂。新建项目增加的排污量，必须控制在本地区允许的排污总量指标之内。
污染物排放总量指标可以在地区内综合平衡，可以在企业之间有条件地调剂余缺，互相转让；但必须经环境保护部门同意。
第十三条 排污单位必须向所在地的区、县环保部门提出污染物排放申请。污染物排放申请应包括污染物种类、排放浓度、数量、时间、排放口位置、污染治理措施以及达到允许排放量的期限等。未经许可，不准擅自排放污染物。
环保部门应根据环境容量及污染物排放总量控制的要求，对各单位的排污申报进行审核。凡达到总量控制要求的，由市环保局发给《上海市企事业单位液体废弃物排放许可证》；凡尚未达到总量控制要求的，发给《上海市企事业单位液体废弃物临时排放许可证》，并提出治理期限，最迟于一九九０年底之前达到总量控制要求。
