（二）根据环境容量组织协调和监督实施水源保护区、准水源保护区水污染防治规划和计划；
（三）配合太湖流域管理局并与江苏、浙江两省协商，共同搞好淀山湖、元荡湖、急水港、太浦河、园泄泾、大泖港等水体的水污染联合防治工作，编制水污染联合防治规划及计划，并商定实施办法；
（四）建立上游水源保护区、准水源保护区的水环境监测网络，进行水质监测，并汇总监测数据，及时掌握水质动态；
（五）颁发《上海市企事业单位液体废弃物排放许可证》，监督原有污染源的限期治理；
（六）负责防止污染和其他公害的设施与主体工程同时设计同时施工、同时投产（以下简称三同时）的审批；
（七）总结推广水污染防治的先进经验和技术，奖励环保先进；
（八）组织调查和处理水污染事故；
（九）征收排污费、超标准排污费。
第七条 各级港航监督机关负责对船舶排污的监督、管理。其主要职责是：
（一）执行并完善黄浦江上游水源保护区、准水源保护区内防止船舶污染的具体办法；
（二）监督船舶的排污，并对船舶造成的水污染事故进行调查处理；
（三）配合环境保护部门监视陆域对水源的污染；
（四）总结推广船舶水污染防治的先进经验和先进技术，奖励环保工作中的先进单位和个人；
（五）定期向市环保局提供
《条例》执行情况。
第八条 规划、水利、市政、渔政、卫生、公用等行政管理部门，应协同环境保护部门做好
《条例》的实施工作。其职责分别是：
规划部门在县域或区域规划、城镇规划和建设项目选址工作中，凡涉及黄浦江上游水源保护区时，必须考虑水源保护的要求；协同环境保护部门、工业主管部门合理调整黄浦江上游地区的工业布局及结构；并协同环境保护部门实施三同时审查。
水利部门应协同环境保护部门对黄浦江上游水源水体进行水质保护；在调节、调度水资源时，必须保证一定的流量，以维护水体的环境质量；并向环保部门提供黄浦江上游地区的水文数据。
市政部门应完善黄浦江上游地区排水和污水处理系统，提高污水处理率及污染物去除率；制定城市排水设施管理办法，并负责调查处理损害排水设施的污水排放事故。
