第十一条 有关部门指定在科研机构中设置的情报、计量、标准、观测和设计等部门，其经费由指定设置的有关部门按任务拨给，有关部门或企、事业单位委托科研机构承担的科技任务，其经费应根据任务需要，由委托部门或单位付给。
第十二条 科研机构离、退休人员的离、退休金由科研事业费中开支，不予减少。完全停拨科研事业费的机构，离、退休金仍应当照拨。
第十三条 科研机构的基本建设投资，按照国家基本建设管理规定办理。
第十四条 凡列入上海市科技发展基金的项目，均应实行合同制。项目成果的权益和推广应用的期限、范围、对象等内容应在合同中明确规定。市科委应根据项目的不同性质、内容以及预测经济效益和偿还能力，对项目分别实行有偿或无偿的拨款办法。
第十五条 凡有一定经济效益和偿还能力的项目，均应签订有偿合同，并在合同中规定全部或部分偿还的金额。企业单位应当在缴纳所得税前用该项目投产后的新增利润归还；事业单位应当用该项目实现的收入归还。有偿合同项目回收的资金，仍纳入市科技发展基金继续使用。
第十六条 对具有推广应用价值但不宜成为商品或不宜实行有偿转让的技术成果项目，或社会效益虽然显著但本单位经济收益不大的项目，一般应采取无偿资助的办法。对无偿资助的项目，市科委可区别情况给予全额资助或部分资助。
第十七条 列入市科技发展基金的项目应逐步实行招标办法，以保证项目指标达到计划要求和资金的合理安排使用。招标项目的经费，采取包干办法，结余留用、超支不补。具体办法由市科委另行制订。
对尚未实行招标的项目，仍采取同行评议、择优支持的办法进行审定。但其经费应在核定的预算开支范围内，采取按项目进度和实际用款情况分期拨款、按实结算。其中一部分拨款，应在项目完成并通过鉴定后再行结算；或者采取先贷后拨、按实结算的办法。项目完成后的结余资金，百分之六十退回市科委，百分之四十留给承担单位作为科技发展基金，继续用于科学技术研究、开发项目。
第十八条 有偿合同项目，如承担单位能按合同如期完成并通过鉴定，同时又能按期常还资金的，市科委可按偿还金额百分之四点八，返回承担单位。其中，一半作为职工福利基金，另一半作为职工奖励基金。
