第八条 严格限制机动船只的数量。在两库一渠各设置少量必要的机动船，供防洪、供水、水源保护管理和水产管理以及公安部门使用，本细则施行后不再增加新的捕渔船只。两库一渠内的一切船只，必须经所在区、县环境保护部门批准，核发许可证后，方可使用。被批准使用的船只，不得向水库排放含油污水、生活污水和垃圾；机动船只要用封闭的加油系统，减少尾气污染，并在限期内更新或改造成为无污染的船只。
第九条 两库的坝上地区，不得设置商业设施，小商贩应到指定的地点经营。一切单位和个人必须遵守水源保护的各项规定，禁止一切旅游车辆上坝。
第十条 市环境保护局、市水利局、市水产总公司在一级保护区内共同划定网箱养鱼的地点，确定网箱养鱼的规模。养鱼单位不得施用对人体有害的高残毒的防治鱼病的药物，并在每年年终，向所在区、县环境保护部门和水库管理部门报告养鱼的数量、种类、饵料及药物投放情况。
第十一条 在二级保护区内建设不向水体排放污水的项目，应在统一规划指导下进行，并经市规划局批准。申请建设的单位在立项、选址时，应征得环境保护部门和水利部门的同意。项目的环境影响报告书（表）和防治污染的工程设计文件，由环境保护部门组织有关单位审查批准，防治污染的工程设施竣工验收不合格的，不准投产或使用。
第十二条 密云水库内湖区和两库坝下地区的开发建设，必须按照经市政府批准的开发建设规划方案进行。
第十三条 保护区内现有直接或间接向水体排放污染物的企、事业单位，应从本细则施行之日起一个月内，向所在区、县环境保护部门申报登记拥有的污水处理、排放设施和在正常作业条件下排放污染物的种类、数量、浓度、去向，提供防治水污染的技术资料，并抄送水利部门。
保护区内原有排放污水的单位，凡超过《北京市水污染物排放标准》的，由环境保护部门限期治理，经治理达到要求的，发给污水排放许可证；仍达不到要求的，令其停产或迁出保护区。
第十四条 保护区内不得进行破坏植被导致水土流失的开发建设。开矿、取土、取石、取砂料，必须向所在区县环境保护部门申报，经批准后方可进行。在开挖作业中，必须有防止水土流失的工程措施，开采后应负责恢复开挖面上的植被。
