（四）财政部、地方各级财政部门根据批复的“三代”税款手续费预算，及时核批用款计划或拨付经费。各级税务机关按照实际发生额及时支付相关手续费。
（五）国税机关、地税机关支付的“三代”税款手续费，分别由财政部与国家税务总局、省级或者省以下财政部门与地税部门在下一年进行据实清算。不足部分，在下年预算中弥补；结余部分，相应扣减下年“三代”税款手续费预算。
五、手续费核算管理
（一）各级税务机关应当单独设置会计科目，及时、全面、完整核算“三代”税款手续费收支情况。
（二）“三代”税款手续费的请领和核拨，按财政部有关规定执行。
（三）省级国税机关应在每年年初将上年“三代”税款手续费收支情况报财政部驻各地财政监察专员办事处，经审核签章后，汇入部门决算报国家税务总局。国家税务总局汇总后报送财政部。
财政部驻各地财政监察专员办事处对“三代”税款手续费进行实地抽样审查，并在10个工作日内完成。
（四）对地税部门“三代”税款手续费核算要求，由省级地方税务局和省级财政部门比照国税部门共同确定。
六、手续费支付管理
（一）税务机关应按照本通知规定的比例支付“三代”税款手续费。
（二）税务机关对单位和个人未按照法律、行政法规或者委托代征协议规定履行代扣、代收、代征义务的，不得支付“三代”税款手续费。
（三）税务机关应在“三代”单位和个人申报并结报票款后，按有关规定支付“三代”税款手续费。对不能及时支付的，应予说明，并在一个季度内结清，最长不得超过6个月。
（四）因税务机关的原因，未领或少领“三代”手续费的单位和个人，有权要求税务机关按照规定及时支付手续费。
因“三代”单位和个人自己的原因，三年不到税务机关领取“三代”税款手续费的，税务机关将停止支付手续费。
（五）税务机关之间委托代征税款，不得支付手续费。
（六）“三代”单位所取得的手续费收入应该单独核算，计入本单位收入，用于“三代”管理支出，也可以适当奖励相关工作人员。
七、手续费的监管
（一）各级税务机关应加强对“三代”税款手续费监督检查，严禁将“三代”税款手续费作为税务机关的行政经费或者挪作它用，也不得用行政经费垫付“三代”税款手续费。
