第三阶段：整改提高（一般为3周）。
整改提高阶段重点抓好三个环节。一是制订整改方案。针对征求到的意见和民主评议中反映的问题，党员个人、基层党组织和领导班子要分别制订整改措施，明确整改要求和时限，落实整改责任。企业党委（党组）和基层党组织的主要负责同志要亲自抓，负总责。二是认真进行整改。要坚持边学边改的原则，对那些需要解决又能够解决的问题，要集中一段时间整改，对需要解决而暂时不具备解决条件的问题，要列出明确的时间表和责任人。三是向职工群众公布整改措施和进行整改的情况。企业领导班子和班子中的党员领导人员的整改，要为下属企业和其他党员作出表率。制订整改措施和进行整改的情况，要在一定范围公布，充分听取职工群众意见，自觉接受监督。每个阶段结束后，经督导组和上级先进性教育活动领导小组同意可转入下一阶段。党的关系在地方的中央企业，转段情况报国资委党委保持共产党员先进性教育活动领导小组办公室备案。
集中学习教育基本结束后，要用两个月左右的时间，切实做好巩固和扩大整改成果的工作。一是对整改情况进行梳理，对应当解决而没有解决的问题，要集中力量切实解决；对暂时解决不了的问题，要向职工群众作出说明；整改效果不好、多数职工群众不满意的，要在上级党组织的监督下重新进行整改。二是党支部对优秀党员以适当方式进行表扬。三是对那些不履行党员义务、已不具备党员条件的，要多做深入扎实的教育工作，促使他们尽快转化为合格的共产党员；对经教育不改、不符合党员条件的，要根据党章和有关规定，按照正常程序进行处理。对违纪党员，要按照《
中国共产党纪律处分条例》的规定，给予纪律处分。对问题一时查不清楚的党员，待问题查清后再根据有关规定进行处理。四是要搞好建章立制，认真贯彻落实《中央组织部、国务院国资委党委关于加强和改进中央企业党建工作的意见》，建立健全基层党组织建设和党员教育管理常抓不懈的工作机制。在先进性教育活动中，要把那些符合党员条件的先进分子吸收到党内来，重点是在生产、工作第一线和青年职工中发展党员，注意在生产经营骨干、技术能手和高知识群体中发展党员，壮大党员队伍。
上述工作结束后，党组织要以适当方式在一定范围向下级企业和党员、干部、职工群众通报先进性教育活动有关情况，并采取职工代表评议和在职工群众中随机抽样调查等形式，由上级党组织对下一级的先进性教育活动进行群众满意度的测评。多数职工群众不满意的，要及时“补课”。
中央企业总部机关和所属企业的先进性教育活动，可根据实际情况“压茬”进行，即在总部机关的先进性教育活动开展后的适当时机，可以启动下属企业的先进性教育活动。
