未经有管辖权的水库综合管理机构同意和水行政主管部门批准，禁止在有效库容范围内的干、支流筑坝拦汊、分割水面、兴建小水库和围垦，以及向水库弃土、弃渣、弃物和填埋物体等一切减少水库库容的行为。建设期库区城镇建设涉及可能会影响水库库容的开发活动，应报三峡建委批准。交通部门要加强对三峡库区沿岸港口及航运设施建设和港航设施岸线资源的管理。港口岸线的使用和构筑水上设施应严格按《
中华人民共和国港口法》及相关规定报相应的主管部门审批，并报同级地方水库综合管理部门备案。
（二十二）对三峡水库水产资源的开发利用，要以保证水库水质、生态安全和船舶航行安全作为前提。各级渔业行政主管部门要依法加强管理，根据养殖容量，从严控制养殖证和渔业捕捞许可证的发放，并将发放情况抄送同级水库综合管理部门。要加强对珍稀特有水生野生动植物的保护以及对名优水产品的开发利用，科学地开展增殖放流工作；严格控制在三峡水库采用污染水体的养殖方式，并由省级渔业行政主管部门进行监督管理；要加强对水生动植物物种引进的监管工作，禁止将可能危害水库生态安全的外来物种引入三峡水库，引进外来物种必须按规定论证，报经农业部批准，并向三峡办通报。环境保护部门要会同有关部门进一步加强三峡库区生物遗传资源的管理。
（二十三）进一步加强三峡库区旅游开发的管理，防止污染和破坏旅游资源。利用水库资源开发旅游项目，应符合经批准的长江三峡风景名胜区总体规划，所有建设项目应按程序报经批准，并抄送同级水库综合管理部门备案。
建设部要加强对三峡库区风景名胜区资源保护和利用的指导与监督，协调督促湖北省、重庆市组织对长江风景名胜区新形成的资源状况进行调查和论证，研究编制新的长江三峡风景名胜区总体规划，并按程序报批。
（二十四）环境保护部门要会同有关部门加强对三峡库区资源开发规划及建设项目的环境影响评价和执法监督，促进资源开发利用与生态环境保护相协调。
（二十五）直接从三峡水库取用水资源，要按照国家取水许可制度和水资源有偿使用制度的规定，向有管辖权的水行政主管部门或者流域管理机构申请办理取水许可证，并缴纳水资源费（家庭生活和零星散养、圈养畜禽饮用等少量取水的除外）。批准单位应当将有关情况向三峡办通报。
（二十六）三峡办要组织湖北省、重庆市人民政府和有关部门编制三峡水库可持续综合利用规划，制定相应的资源管理办法，并报三峡建委批准。
