编制及处室设置：行政编制37名，设综合处、法律事务与稽查处、食品安全政策信息处、食品安全标准处、食品安全评估预警处、食品安全重大事故督查处、职业卫生监督管理处、放射卫生监督管理处、环境卫生监督管理处、传染病防治监督与学校卫生监督管理处、医疗执法监督处。
十二、药物政策与基本药物制度司
主要职责：承担研究建立国家基本药物制度并组织实施；组织拟订国家药物政策和国家基本药物的法律、法规与规章；组织拟订、颁布药品法典；组织国家基本药物的遴选工作，拟订和管理国家基本药物目录；拟订国家基本药物的采购、配送、使用的政策措施；会同有关方面提出国家基本药物目录内药品生产的鼓励扶持政策，提出国家基本药物价格政策的建议；负责国家药物政策的研究和评估；负责组织国家基本药物制度实施的监测；组织拟订监督和促进基本药物合理使用的政策措施，并组织实施；组织拟订国家基本药物使用规范和临床应用指南；组织开展国家基本药物的循证医学、药物经济学评价与信息化建设；负责基本药物制度推广宣传教育工作。
编制及处室设置：行政编制11名，设药物政策研究处、基本药物制度处、基本药物管理处。
十三、科技教育司
主要职责：拟订医药卫生科技发展规划，组织实施科技重大专项、卫生公益性行业科研专项、国家科技支撑计划项目等国家医药科研项目；承担相关的国家重点实验室、工程中心及卫生行业重点科研基地的管理工作；组织实施医学卫生技术的标准研究和技术评估；拟订医疗卫生技术推广的政策措施并指导实施；拟订高新卫生技术临床试验研究管理规范、规章制度并监督实施；指导协调卫生科学知识普及工作；拟订实验室生物安全管理的相关政策，承担与人体健康有关的实验室生物安全的监督管理工作；协助认监委有关卫生行业实验室资质认定的相关工作；参与拟订国家医学教育发展规划；组织协调卫生专业技术岗位的培训；指导乡村医生培训工作；负责毕业后医学教育、继续医学教育的组织管理工作。
编制及处室设置：行政编制17名，设综合处、规划处、技术处、实验室管理处、教育处。
十四、国际合作司（港澳台办公室）
主要职责：拟订卫生领域的政府间、民间的多、双边合作交流政策并承担组织指导工作；组织、协调我国与世界卫生组织及其他国际组织在卫生领域的交流与合作；指导、组织、协调双边政府间卫生合作；指导、组织、协调卫生援外工作；指导、组织、协调卫生国际合作项目立项、签署、实施和督导；指导、组织、协调与国外民间组织的卫生合作交流，指导我部业务主管境外非政府组织在华开展卫生合作以及我部业务主管（挂靠）社团开展国际合作交流；负责因公出国（境）人员团组的审批以及在华举办国际会议审报批。负责卫生部及直属单位引智工作；指导、组织、协调与港澳台的卫生合作工作；负责部机关外事工作；参与对外推荐国际职员和选派驻外机构人员。
